MIT coopera estrechamente con las agencias del gobierno involucradas en la liberación de los contenedores y de la carga. Tanto Aduanas como Cuarentena tienen sus oficinas dentro del terminal y están conectados con el sistema Mainsail de MIT para registrar liberaciones en línea.

MIT está certificado por el Ministerio de Desarrollo Agropecuario (MIDA) como zona fito y zoosanitaria. Esta certificación nos permite manejar cargas sensitivas, tales como café, cueros y otros productos agropecuarios.